More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3820 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  67.5 
 
 		 527 aa  698    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  66.47 
 
 		 522 aa  677    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  100 
 
 		 528 aa  1058    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  66.13 
 
 		 539 aa  622  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  60.16 
 
 		 510 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  59.06 
 
 		 545 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  59.76 
 
 		 523 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  60.28 
 
 		 516 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  58.15 
 
 		 520 aa  581  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 		 525 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  56.2 
 
 		 525 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  46.14 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.54 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  43.46 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  42.54 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  44 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.54 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  42.14 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  42.16 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  44.98 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  38.76 
 
 		 491 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  44.78 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  44.56 
 
 		 521 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  42.2 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  42.27 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  42.62 
 
 		 504 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 		 494 aa  359  8e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 		 494 aa  359  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 		 494 aa  359  9e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37.53 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  43.51 
 
 		 499 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  45.18 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.64 
 
 		 495 aa  350  3e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  41.96 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 507 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.62 
 
 		 503 aa  339  8e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 		 499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  36.84 
 
 		 499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  37.05 
 
 		 511 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 505 aa  336  7.999999999999999e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 		 517 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  35.5 
 
 		 499 aa  334  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.61 
 
 		 517 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.61 
 
 		 517 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 517 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  35.76 
 
 		 513 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  40.4 
 
 		 498 aa  330  6e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  36.9 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.26 
 
 		 504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  37.55 
 
 		 503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  36.67 
 
 		 512 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  38.81 
 
 		 535 aa  326  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 		 523 aa  326  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 497 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  39.92 
 
 		 518 aa  325  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  33.93 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  36.42 
 
 		 514 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  36.04 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  36.04 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  38.72 
 
 		 499 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  38.4 
 
 		 514 aa  323  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.02 
 
 		 511 aa  323  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  39.96 
 
 		 517 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  39.96 
 
 		 517 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  39.96 
 
 		 517 aa  323  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  37.71 
 
 		 524 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  37.71 
 
 		 524 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.77 
 
 		 492 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  37.71 
 
 		 524 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  37.63 
 
 		 524 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  38.74 
 
 		 519 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  35.9 
 
 		 513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  35.77 
 
 		 495 aa  321  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.29 
 
 		 527 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  37.75 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  37.21 
 
 		 524 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  34.42 
 
 		 501 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  39.59 
 
 		 499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 		 508 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  36.46 
 
 		 508 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  40.08 
 
 		 517 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  40.41 
 
 		 507 aa  320  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  39.88 
 
 		 519 aa  319  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  35.69 
 
 		 520 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  37.92 
 
 		 522 aa  319  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  36.7 
 
 		 525 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  38.7 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  37.89 
 
 		 499 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  36.35 
 
 		 513 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  37.01 
 
 		 524 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  36.13 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  37.73 
 
 		 525 aa  318  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  37.25 
 
 		 503 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38.39 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  36.78 
 
 		 512 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>