More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4329 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  68.24 
 
 		 527 aa  668    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  65.17 
 
 		 545 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  64.68 
 
 		 516 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  100 
 
 		 539 aa  1066    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  65.88 
 
 		 523 aa  670    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  64.81 
 
 		 510 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  66.2 
 
 		 528 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  59.4 
 
 		 520 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  58.71 
 
 		 522 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  60.71 
 
 		 525 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 		 525 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  46.94 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  47.79 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  48.29 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  48.29 
 
 		 497 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.43 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  44.03 
 
 		 498 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  45.45 
 
 		 521 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.03 
 
 		 498 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.03 
 
 		 498 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  42.8 
 
 		 500 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  44.74 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  49 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 494 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 494 aa  379  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 494 aa  379  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 504 aa  369  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  42.89 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  39.29 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.47 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  42.6 
 
 		 508 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  42.57 
 
 		 504 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  42.91 
 
 		 499 aa  359  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  42.94 
 
 		 504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.11 
 
 		 514 aa  356  5e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.35 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.92 
 
 		 504 aa  353  5e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 517 aa  352  8e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  43.12 
 
 		 507 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.38 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  41.05 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 		 535 aa  350  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  42.97 
 
 		 517 aa  349  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.16 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.16 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.17 
 
 		 512 aa  347  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  38.06 
 
 		 498 aa  346  8e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  38.63 
 
 		 500 aa  345  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.7 
 
 		 524 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.1 
 
 		 513 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  39.68 
 
 		 511 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.77 
 
 		 517 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  39.07 
 
 		 511 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  43.03 
 
 		 517 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  43.03 
 
 		 517 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  39.8 
 
 		 509 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  43.08 
 
 		 507 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  42.89 
 
 		 520 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.07 
 
 		 517 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  42.83 
 
 		 517 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  38.57 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  38.24 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  40.51 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  42.3 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  42.3 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  38.52 
 
 		 515 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  40.35 
 
 		 522 aa  340  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 		 540 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 		 516 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.39 
 
 		 514 aa  339  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  38.91 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  38.31 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  38.31 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  43.25 
 
 		 499 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  40.44 
 
 		 516 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  39.13 
 
 		 505 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  42.75 
 
 		 519 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.82 
 
 		 495 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  41.45 
 
 		 514 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.45 
 
 		 514 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41.45 
 
 		 514 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  35.33 
 
 		 499 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  38.18 
 
 		 524 aa  335  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  37.65 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  39.64 
 
 		 501 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  39.12 
 
 		 518 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 525 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.79 
 
 		 512 aa  334  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  39 
 
 		 525 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  38.57 
 
 		 513 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.57 
 
 		 520 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  36.99 
 
 		 495 aa  333  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 		 523 aa  333  7.000000000000001e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  37.43 
 
 		 501 aa  332  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.38 
 
 		 524 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.38 
 
 		 524 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>