More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0928 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  99.4 
 
 		 504 aa  1019    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  99.6 
 
 		 504 aa  1026    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 504 aa  1028    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  63.65 
 
 		 507 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  54.97 
 
 		 499 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  54.07 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  51.24 
 
 		 520 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  50.61 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  50.2 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  49.29 
 
 		 508 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 		 494 aa  477  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  47.54 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  46.44 
 
 		 499 aa  445  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  45.49 
 
 		 499 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  41.09 
 
 		 523 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  41.62 
 
 		 510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.7 
 
 		 516 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  45.44 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  45.44 
 
 		 497 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  42.16 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  43.29 
 
 		 498 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  42.83 
 
 		 522 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  44.9 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  41.08 
 
 		 527 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.65 
 
 		 503 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  43.41 
 
 		 521 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.9 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  42.17 
 
 		 520 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.22 
 
 		 496 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.7 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  45.84 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.61 
 
 		 508 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.01 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.71 
 
 		 508 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  39.96 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.96 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  39.68 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  37.63 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  42.08 
 
 		 539 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  39.96 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  39.55 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.15 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.16 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.15 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  40.12 
 
 		 522 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  40.84 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.03 
 
 		 497 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.06 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  40.21 
 
 		 518 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  40.2 
 
 		 505 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  41.55 
 
 		 519 aa  365  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  38.21 
 
 		 508 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  38.62 
 
 		 492 aa  363  4e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.51 
 
 		 516 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.63 
 
 		 513 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39.84 
 
 		 510 aa  363  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.6 
 
 		 501 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38.95 
 
 		 497 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.43 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.88 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 501 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.09 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  39.76 
 
 		 502 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2268  ABC transporter related  39.17 
 
 		 495 aa  360  5e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  36.81 
 
 		 501 aa  359  6e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 505 aa  359  6e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 511 aa  359  7e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  38.41 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  40.57 
 
 		 511 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  41.81 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  38.13 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  36.97 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  38.46 
 
 		 503 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 		 525 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  40.2 
 
 		 525 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  39.06 
 
 		 494 aa  356  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.42 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  40.12 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  38.61 
 
 		 524 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  38.71 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  40.51 
 
 		 511 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  39.8 
 
 		 537 aa  353  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 505 aa  353  5e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  38.21 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 504 aa  353  5.9999999999999994e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  39.83 
 
 		 509 aa  352  7e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 513 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.55 
 
 		 511 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.19 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  37.04 
 
 		 498 aa  352  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  37.92 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  37.92 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>