More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0785 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  100 
 
 		 499 aa  986    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  55.89 
 
 		 520 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  51.83 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  50.91 
 
 		 504 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 498 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 498 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  50 
 
 		 498 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  50.9 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  50.3 
 
 		 507 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  46.44 
 
 		 504 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 504 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  44.99 
 
 		 491 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  47.37 
 
 		 498 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  47.84 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  44.27 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  45.88 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  45.67 
 
 		 497 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  43.51 
 
 		 528 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  44.38 
 
 		 527 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  46.28 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  44.04 
 
 		 521 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.98 
 
 		 519 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  42.38 
 
 		 501 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  42.44 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  40.68 
 
 		 520 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.83 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.28 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  41.25 
 
 		 523 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  38.91 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  38.91 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  45.03 
 
 		 500 aa  362  9e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.03 
 
 		 499 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 504 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  40.16 
 
 		 510 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.39 
 
 		 511 aa  359  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  38.03 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.29 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  35.73 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 521 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.42 
 
 		 508 aa  356  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.08 
 
 		 525 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  42.08 
 
 		 525 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.92 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  41.32 
 
 		 522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.87 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  42.83 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.84 
 
 		 516 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.76 
 
 		 861 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.02 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 517 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  39.61 
 
 		 506 aa  350  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  43.82 
 
 		 539 aa  350  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  40.46 
 
 		 511 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  36.27 
 
 		 495 aa  348  9e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  41.83 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  41.07 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  41.63 
 
 		 517 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  42.17 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  42.17 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  42.17 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  41.94 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  40.12 
 
 		 518 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  39.62 
 
 		 511 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  42.12 
 
 		 507 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 517 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 517 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 517 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 		 517 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  42.92 
 
 		 525 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  42.92 
 
 		 525 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  37.8 
 
 		 524 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  43.83 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  40 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  40.59 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  41.01 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  33.95 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  39.88 
 
 		 503 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  38.68 
 
 		 512 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  40.21 
 
 		 503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  36.53 
 
 		 497 aa  339  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  38.92 
 
 		 516 aa  340  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.96 
 
 		 513 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.74 
 
 		 495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  43.13 
 
 		 499 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  39.96 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.33 
 
 		 514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  40.13 
 
 		 537 aa  337  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.23 
 
 		 512 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.23 
 
 		 512 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  41.81 
 
 		 523 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  37.66 
 
 		 509 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>