More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5311 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  92.46 
 
 		 504 aa  944    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  100 
 
 		 504 aa  1009    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  77.28 
 
 		 508 aa  775    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  63.41 
 
 		 520 aa  623  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  50.81 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 		 504 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  50.49 
 
 		 507 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 		 504 aa  477  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  51.83 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  46.86 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.55 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 		 494 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  45.55 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.55 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  44.58 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  44.01 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  43.93 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  45.42 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  44.62 
 
 		 519 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  43.52 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.61 
 
 		 508 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  46.07 
 
 		 497 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  46.07 
 
 		 497 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.89 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.3 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  42.71 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.67 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  43.8 
 
 		 519 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  43.09 
 
 		 511 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  43.01 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  44.63 
 
 		 521 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.53 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.8 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  42.01 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  41.12 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  42.2 
 
 		 528 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  42.09 
 
 		 537 aa  364  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  41.88 
 
 		 512 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.2 
 
 		 524 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.12 
 
 		 545 aa  363  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  41.87 
 
 		 523 aa  362  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.89 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  40.98 
 
 		 500 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  41.74 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  41.39 
 
 		 522 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  42.57 
 
 		 517 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  41.23 
 
 		 861 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.17 
 
 		 515 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  42.36 
 
 		 517 aa  359  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.49 
 
 		 520 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  40.62 
 
 		 508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  45.97 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  41.06 
 
 		 510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  40.29 
 
 		 516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  41.97 
 
 		 517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  41.97 
 
 		 517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  41.97 
 
 		 517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  40.92 
 
 		 513 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 525 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  41.88 
 
 		 517 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  40.04 
 
 		 501 aa  355  7.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  40.59 
 
 		 518 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.54 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.54 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  38.84 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  42.32 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  38.62 
 
 		 510 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 510 aa  353  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  39.55 
 
 		 503 aa  353  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 		 517 aa  352  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.12 
 
 		 517 aa  352  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  39.59 
 
 		 525 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  39.84 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.06 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.63 
 
 		 514 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41.63 
 
 		 514 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 504 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  39.92 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40.58 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  44.49 
 
 		 505 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  41.86 
 
 		 498 aa  349  5e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  39.08 
 
 		 508 aa  350  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.2 
 
 		 514 aa  349  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  39.43 
 
 		 501 aa  349  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.44 
 
 		 503 aa  349  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 		 522 aa  349  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  41.34 
 
 		 509 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  42.57 
 
 		 539 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  41.53 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40.44 
 
 		 516 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  39.73 
 
 		 520 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  39.79 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  40.08 
 
 		 516 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 		 515 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>