More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3723 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  100 
 
 		 507 aa  1036    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  63.65 
 
 		 504 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  63.86 
 
 		 504 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  63.65 
 
 		 504 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  53.66 
 
 		 499 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.78 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.78 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  52.78 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  56.24 
 
 		 520 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  50.49 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  50.8 
 
 		 508 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.5 
 
 		 494 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.5 
 
 		 494 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  50.1 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.3 
 
 		 494 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  49.19 
 
 		 491 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  50.3 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  45.82 
 
 		 499 aa  428  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  44.2 
 
 		 498 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  44.49 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  43.31 
 
 		 500 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  44.29 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  42.25 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  41.07 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 		 545 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.28 
 
 		 516 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  39.44 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.58 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  43.22 
 
 		 521 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  40.97 
 
 		 527 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 497 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  40.12 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  39.6 
 
 		 495 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  40.67 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  40.44 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.9 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  44.69 
 
 		 497 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.91 
 
 		 515 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  40.65 
 
 		 495 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  41.75 
 
 		 528 aa  362  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  41.09 
 
 		 522 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  39.47 
 
 		 861 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.45 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.24 
 
 		 495 aa  359  7e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  39.67 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  39.76 
 
 		 514 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  37.06 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.79 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.28 
 
 		 499 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.64 
 
 		 512 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.64 
 
 		 512 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.28 
 
 		 499 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2268  ABC transporter related  38.34 
 
 		 495 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.54 
 
 		 517 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.17 
 
 		 520 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  41.21 
 
 		 516 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.67 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.35 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  43.12 
 
 		 539 aa  353  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  41.39 
 
 		 501 aa  352  7e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.08 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  39.72 
 
 		 503 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.44 
 
 		 512 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.3 
 
 		 495 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  38.49 
 
 		 500 aa  351  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.2 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  39.68 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  40.56 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  41.37 
 
 		 498 aa  350  3e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  38.23 
 
 		 508 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  39.47 
 
 		 507 aa  350  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.92 
 
 		 513 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41 
 
 		 514 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41 
 
 		 514 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.16 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.48 
 
 		 496 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  38.28 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  40.8 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  40.82 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.16 
 
 		 514 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.96 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  40.56 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  41.28 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  38.59 
 
 		 504 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  39.54 
 
 		 502 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0437  ABC transporter related  38.66 
 
 		 501 aa  347  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.17 
 
 		 501 aa  347  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  40 
 
 		 511 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.51 
 
 		 500 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  37 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 505 aa  345  1e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  39.1 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  42.24 
 
 		 518 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  39.08 
 
 		 501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.43 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2114  ABC transporter related  40.37 
 
 		 504 aa  343  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  39.96 
 
 		 507 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>