More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1337 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  100 
 
 		 527 aa  1038    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  63.48 
 
 		 523 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  63.65 
 
 		 545 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  64.44 
 
 		 516 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  65.35 
 
 		 522 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  68.24 
 
 		 539 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  64.43 
 
 		 510 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  67.5 
 
 		 528 aa  698    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  59 
 
 		 520 aa  591  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  58.59 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.59 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  46.73 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  45.18 
 
 		 498 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  46.6 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  46.8 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  43.06 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 498 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  47.4 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 498 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  42.15 
 
 		 498 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  45.13 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  41.72 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  41.25 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  39.62 
 
 		 491 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  41.87 
 
 		 508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  42.12 
 
 		 514 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.12 
 
 		 495 aa  356  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  42.65 
 
 		 514 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  42.65 
 
 		 514 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  44.17 
 
 		 499 aa  354  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.46 
 
 		 503 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  40.97 
 
 		 507 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  42.45 
 
 		 504 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  42.59 
 
 		 507 aa  349  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  36.1 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  39.68 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  41.01 
 
 		 535 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.43 
 
 		 513 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  38.45 
 
 		 495 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  41.98 
 
 		 504 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 504 aa  346  5e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  42.83 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  41.65 
 
 		 516 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  41.48 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  39 
 
 		 524 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  39 
 
 		 524 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.53 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  38.4 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.74 
 
 		 501 aa  340  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  39.02 
 
 		 511 aa  340  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  42.19 
 
 		 519 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  38.8 
 
 		 512 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  38.8 
 
 		 524 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.46 
 
 		 501 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.34 
 
 		 516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  38.28 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  38.27 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.38 
 
 		 527 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  38.88 
 
 		 518 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  38.1 
 
 		 503 aa  336  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 517 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  37.2 
 
 		 516 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  37.89 
 
 		 499 aa  334  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  37.89 
 
 		 499 aa  334  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.98 
 
 		 499 aa  333  4e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 505 aa  333  4e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  38.07 
 
 		 524 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.25 
 
 		 520 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  37.75 
 
 		 511 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  35.07 
 
 		 494 aa  332  9e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  38.92 
 
 		 521 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  38.43 
 
 		 507 aa  332  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2984  ABC transporter related  40.28 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.095171  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  37.73 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  38.48 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  40.73 
 
 		 517 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  40.91 
 
 		 518 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  40.2 
 
 		 519 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  40.73 
 
 		 517 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.37 
 
 		 515 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  37.67 
 
 		 513 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  41.25 
 
 		 517 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  41.25 
 
 		 517 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 		 515 aa  329  9e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  36.42 
 
 		 511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  38.88 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  38.81 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  39.05 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  39.05 
 
 		 499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 		 510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  41.46 
 
 		 517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>