More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0530 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  100 
 
 		 498 aa  995    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  50.92 
 
 		 499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  49.7 
 
 		 500 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  47.14 
 
 		 521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  50.52 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  50.52 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.81 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.81 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  45.81 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 		 499 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  50.93 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  45.38 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.44 
 
 		 545 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  44.4 
 
 		 510 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  45.18 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.38 
 
 		 516 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  46.14 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  45.07 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.07 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  44.18 
 
 		 520 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  47.79 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  47.37 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  41.77 
 
 		 491 aa  389  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  43.52 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  43.74 
 
 		 522 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  44 
 
 		 508 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  43.74 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 507 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  43.5 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  44.73 
 
 		 520 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.34 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.39 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  40.85 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  40.95 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  40.68 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  42.61 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.99 
 
 		 499 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 504 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.01 
 
 		 503 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  38.36 
 
 		 516 aa  359  7e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  38.07 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  39.18 
 
 		 508 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  38.93 
 
 		 495 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  40.51 
 
 		 509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39.59 
 
 		 510 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  40.85 
 
 		 511 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  42.64 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.22 
 
 		 519 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 525 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  38.62 
 
 		 524 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.91 
 
 		 511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  40.38 
 
 		 500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 		 523 aa  352  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  39.58 
 
 		 505 aa  352  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  41.21 
 
 		 516 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  41.14 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  38.36 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  40.47 
 
 		 509 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  38.57 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  39.3 
 
 		 511 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  38.28 
 
 		 503 aa  352  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  38.6 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 		 508 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  39.67 
 
 		 503 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.16 
 
 		 527 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 497 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  41.91 
 
 		 506 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  38.78 
 
 		 509 aa  350  4e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.27 
 
 		 524 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  38.81 
 
 		 515 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  38.78 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  38.93 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  41.31 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  37.96 
 
 		 524 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  39.09 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  37.96 
 
 		 524 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.09 
 
 		 492 aa  347  2e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  37.96 
 
 		 524 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  38.13 
 
 		 518 aa  347  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  38.3 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  37.27 
 
 		 497 aa  346  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  36.91 
 
 		 513 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  37.11 
 
 		 511 aa  345  8e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  37.82 
 
 		 515 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  41.7 
 
 		 506 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  40.12 
 
 		 521 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  37.91 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  41.91 
 
 		 528 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.77 
 
 		 506 aa  342  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  36.63 
 
 		 496 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0437  ABC transporter related  38.19 
 
 		 501 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  38.29 
 
 		 513 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>