99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1459 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  57.69 
 
 		 83 aa  97.1  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  64.1 
 
 		 80 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  48.68 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  52.56 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  54.05 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  54.79 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  56.16 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  56.16 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  51.35 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  50.65 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  52.78 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  52.7 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  45.33 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4252  hypothetical protein  49.33 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79426  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  45.83 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  46.81 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  55 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  48.84 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  46.51 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  46.51 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  43.18 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  46.51 
 
 		 92 aa  47.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  42.55 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  42.5 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  43.75 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  44.68 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  44.19 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  40.91 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  38.3 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0594  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  45 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 84 aa  42  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  41.86 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1323  FmdB family regulatory protein  31.17 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.334472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  46.51 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  41.86 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  41.86 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  41.86 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  41.86 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  41.86 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  41.86 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  41.86 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  41.86 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 142 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 72 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 90 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  39.53 
 
 		 120 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  36.99 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  43.18 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  42.22 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  39.53 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  44.19 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  40.82 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  41.86 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  42.55 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  41.86 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  42.55 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  41.86 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1455  hypothetical protein  30.67 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00739456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  40.91 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  51.52 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 109 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 109 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  48.78 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  39.53 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  38.64 
 
 		 88 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  35.82 
 
 		 110 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>