83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0261 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  53.42 
 
 		 75 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  48.68 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  56 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  54.79 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  50.68 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  43.42 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  43.06 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  50.68 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  50.68 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  50.68 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  47.22 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  40.79 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4252  hypothetical protein  50.68 
 
 		 76 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79426  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  45.95 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  47.37 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  38.18 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  41.51 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  41.51 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  38.18 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  40.38 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  48.98 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  39.62 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  39.62 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  39.62 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  39.62 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  39.62 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  39.62 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  41.51 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  41.51 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  41.51 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  39.62 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  41.51 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  41.51 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  45.65 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  39.62 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  39.62 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  46.94 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  39.62 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  34.43 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  34.43 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  34.43 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0594  FmdB family regulatory protein  46.34 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  41.51 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  41.51 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  39.62 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  37.74 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  34.55 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  37.74 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  33.85 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  41.51 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  33.85 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  43.18 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  39.62 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  39.62 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  36.17 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  36.84 
 
 		 83 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  32.88 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  40.74 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  32.81 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  32.73 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  30.91 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  40.74 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  41.86 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  36.54 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  38.6 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  39.62 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  40.38 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  35.71 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  35.71 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  36.96 
 
 		 162 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 83 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  41.3 
 
 		 78 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>