28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4703 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  85.14 
 
 		 75 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  85.33 
 
 		 75 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  65.75 
 
 		 75 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  63.01 
 
 		 75 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4252  hypothetical protein  64.38 
 
 		 76 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79426  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  52.7 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  50.68 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  58.67 
 
 		 76 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  58.67 
 
 		 76 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  45.83 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  44.59 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  47.22 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  37.84 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  45.21 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  48.78 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  48.84 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0594  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  48.84 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  48.84 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  39.02 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  47.5 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  40.48 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  43.48 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  44.44 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  38.1 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>