27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4303 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 75 aa  157  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  61.64 
 
 		 75 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  60.27 
 
 		 75 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  56 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  55.41 
 
 		 75 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  63.01 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  51.35 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  48.61 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4252  hypothetical protein  56 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79426  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  55.41 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  55.41 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  46.67 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  45.33 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  51.39 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  41.1 
 
 		 80 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  41.03 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  47.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  44.68 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  42 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  28.77 
 
 		 108 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  37.78 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  37.78 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0594  FmdB family regulatory protein  45 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  39.02 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  39.13 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2748  cytochrome c family protein, putative  39.13 
 
 		 181 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>