27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5314 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 75 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  83.78 
 
 		 75 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  85.33 
 
 		 75 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  68.49 
 
 		 75 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  60.27 
 
 		 75 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4252  hypothetical protein  61.64 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79426  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  54.05 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  50.68 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  45.83 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  54.67 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  54.67 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  47.3 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  44.44 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  46.58 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  55 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  51.22 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  51.16 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  41.07 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  51.16 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  48.89 
 
 		 99 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0594  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  39.02 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>