31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7750 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 80 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  64.1 
 
 		 78 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  47.44 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  47.37 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  51.28 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  52.05 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  45.83 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  45.95 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  45.33 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  50.68 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  50.68 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  44.44 
 
 		 80 aa  66.6  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  48.61 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  44.59 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4252  hypothetical protein  47.95 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79426  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  41.1 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  42.5 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  42.55 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  43.75 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  43.75 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  45.1 
 
 		 78 aa  43.9  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  47.73 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  43.18 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  37.25 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  44.19 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  46.51 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  43.18 
 
 		 83 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>