42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1286 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 76 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  46.25 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  60 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  43.42 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  60.98 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  61.9 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  51.02 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  58.14 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  35.48 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  51.16 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  47.92 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  38.89 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  37.68 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  37.68 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  47.92 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  42.11 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  45.83 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  38.67 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  38.1 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  35.21 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  51.16 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 75 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  43.18 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1891  FmdB family regulatory protein  39.22 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00708289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  37.14 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  32.31 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  45 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  45 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  40.62 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  37.5 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  34.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 142 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>