162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3010 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  57.3 
 
 		 99 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  63.01 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  63.77 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  56.32 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  53.62 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  46.25 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  40.62 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  43.9 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  43.16 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  41.67 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  38.1 
 
 		 88 aa  67  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  45.95 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  42.47 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  47.06 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  35.87 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  35.87 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  42.62 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  42.62 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  42.11 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  36.9 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  45.59 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  36.67 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  45 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  49.12 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  34.02 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  33.71 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  41.94 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  32.58 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  46.03 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  38.64 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  40.26 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  44.83 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  34.04 
 
 		 95 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  46.77 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  42.11 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  37.84 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  40.45 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  38.2 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  38.2 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  35.23 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  43.1 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  36.36 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  44.83 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  45.83 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  37.04 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  38.33 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  39.66 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  39.73 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  41.38 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  43.75 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  38.71 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  38.71 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  41.38 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  37.93 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  30.56 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  39.34 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  34.72 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  40.68 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  44.07 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  34.38 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  34.72 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  36.25 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  34.72 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  34.72 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  36 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  39.34 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  33.93 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  37.33 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  37.33 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  36.11 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  37.33 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  41.38 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  38.81 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  32.18 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  37.84 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  36.21 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  30.85 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  30.77 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  39.66 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  34.72 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  31.25 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  36.84 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>