160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01549 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 97 aa  197  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  48.91 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  53.25 
 
 		 73 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  56.67 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  47.62 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  50.75 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  55.38 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  52.38 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  54.69 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  47.3 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  50.65 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  57.63 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  48.57 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  49.35 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  44.59 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  44.59 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  44 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  42.7 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  49.35 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  49.35 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  57.63 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  41.24 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  52.46 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  52.54 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  46.59 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  45.57 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  52.54 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  57.63 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  57.63 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  46.15 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  52.54 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  50.82 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  50.82 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  50.82 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  50.82 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  50.82 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  50.82 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  52.54 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  55 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  53.23 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  51.72 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  52.54 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  50.82 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  51.72 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  52.54 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  50.82 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  52.54 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  52.54 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  52.54 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  40 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  40.45 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  45.31 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  45.31 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  43.75 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  40.91 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  40.91 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  42.19 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  41.67 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  43.33 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  42.37 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  36.21 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  40.68 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  37.23 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  39.33 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  35.94 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  37.1 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  37.93 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  41.38 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  35.35 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  43.1 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  43.1 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  34.78 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  38.6 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  35.62 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  30.21 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  37.93 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  38.98 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  40.68 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  37.7 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  35 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  35.56 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  39.66 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  37.29 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  42.37 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  32.86 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  38.6 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  32.26 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  43.1 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  34.43 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  32.76 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  34.43 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>