156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2573 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 
86 aa  171  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  92.42 
 
 
81 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  76.92 
 
 
90 aa  106  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  62.79 
 
 
86 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  75.86 
 
 
92 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  67.69 
 
 
115 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  66.2 
 
 
119 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  66.18 
 
 
132 aa  100  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  70.31 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  74.14 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  66.15 
 
 
120 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  73.21 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  68.33 
 
 
117 aa  97.1  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  74.14 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  70 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  70 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  70 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  74.55 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  65 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  56.41 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  63.77 
 
 
128 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  73.68 
 
 
137 aa  94  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  67.86 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  67.24 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  61.54 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  71.43 
 
 
115 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  68.97 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  73.21 
 
 
111 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  62.86 
 
 
125 aa  91.3  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  64.91 
 
 
95 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23900  putative regulatory protein, FmdB family  67.24 
 
 
90 aa  89  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  63.08 
 
 
113 aa  87.8  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  67.86 
 
 
67 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  60 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  62.07 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  58.93 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  58.49 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  44.83 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  49.33 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  48 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  45.07 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  46.75 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  46.84 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  48.61 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  48.61 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  46.75 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  48.61 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  48.61 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  50.72 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  45.83 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  56.67 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  43.04 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  43.04 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  49.25 
 
 
83 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  43.68 
 
 
114 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  52.63 
 
 
61 aa  67  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  45.83 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  47.22 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  49.3 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  49.3 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  49.3 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  48.57 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  46.48 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  47.69 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  48.33 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  36.11 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  36.11 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  47.69 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  51.72 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  44.62 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  40.54 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  41.79 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  46.55 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  50.85 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  44.44 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  49.15 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  49.15 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  45.76 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  49.15 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  49.15 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  41.18 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  45.9 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  43.55 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  48.28 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  40.85 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  41.94 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  50.88 
 
 
58 aa  61.6  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  44.64 
 
 
74 aa  60.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  46.67 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  36.23 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  44.3 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  47.62 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  36.36 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  38.64 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  47.37 
 
 
90 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  38.81 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>