127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3101 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 83 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  68.57 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  62.86 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  54.43 
 
 		 99 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  63.93 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  50 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  49.33 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  55.56 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  52.94 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  54.1 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  49.21 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  42.17 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  50.85 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  50.85 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  50.85 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  44 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  38.27 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  36.67 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  51.79 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  42.47 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  42.47 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  46.55 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  40.51 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  39.76 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  42.03 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  49.15 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  35.8 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  40.28 
 
 		 78 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  35.71 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  37.04 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  41.82 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  41.51 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  38.18 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  34.21 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  34.21 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  36.9 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  39.76 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  37.74 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  43.1 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  33.8 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  51.92 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  37.74 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  33.78 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  35.37 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  41.51 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  38.89 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  33.73 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  33.87 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  34.85 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  36.84 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  32.56 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  37.93 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  43.1 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  36.92 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  43.1 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  41.38 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  43.33 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  39.62 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  35.94 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  39.62 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  37.74 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  34.72 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  34.72 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3030  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  37.74 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  44.07 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  37.74 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  36.47 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  32.5 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  37.93 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  37.88 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  39.66 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  38.98 
 
 		 90 aa  43.9  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  42.42 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  35.62 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  35.8 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  31.43 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  37.93 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  38.98 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  37.74 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  35.94 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  35.85 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  39.06 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  35.85 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  35.48 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  31.51 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  32.88 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  39.06 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>