28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3030 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3030  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 103 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  40.91 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  34.33 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  36.62 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  48.08 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  36.92 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0665  FmdB family regulatory protein  34.43 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000563996  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  43.75 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  38.18 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  36.84 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  29.67 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  32.93 
 
 		 83 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  46.34 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  37.88 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  48.78 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  33.71 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  32.95 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  48.84 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  38.89 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_640  hypothetical protein  37.78 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000170615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  48.84 
 
 		 66 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  48.84 
 
 		 66 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>