54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2577 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 
66 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 
66 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  74.24 
 
 
65 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  42.11 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  35.14 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  47.17 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  42.42 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  34.48 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  50.98 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  41.54 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  52.27 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  45.9 
 
 
66 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  32.31 
 
 
79 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2431  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000696876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  38.81 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  37.29 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  42 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  44.64 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  40 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  31.34 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  42 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  42.31 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  35.85 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  42.86 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  50 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2281  regulatory protein, FmdB family  47.73 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  45.1 
 
 
83 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  39.22 
 
 
80 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 
76 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  47.83 
 
 
75 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  41.3 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  38.3 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  38.3 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  45.45 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  32.26 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  32.81 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  42.55 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  46.51 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2748  cytochrome c family protein, putative  41.51 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  42.55 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1891  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00708289  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  38.89 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  38.57 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  48.84 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1903  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.056161  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>