42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4161 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 125 aa  254  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  56.25 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  55.32 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  53.19 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1903  FmdB family regulatory protein  47.54 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.056161  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2281  regulatory protein, FmdB family  36.79 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2748  cytochrome c family protein, putative  31.78 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0721  FmdB family regulatory protein  32.12 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.538439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  30.77 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  43.75 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  37.21 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  43.75 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  43.75 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  45.83 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  43.75 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  39.53 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  39.53 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  39.58 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  43.75 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  42.55 
 
 		 99 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  37.78 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  34.04 
 
 		 73 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  41.3 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  42.55 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  31.82 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  38.3 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0029  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 67 aa  40  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 115 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>