57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0583 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 78 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  71.74 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  45.57 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  69.57 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  60.98 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  43.37 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  64.1 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  36.62 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  48.98 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  53.66 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  58.54 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  41.03 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  55 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  40.54 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  45.1 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  37.97 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  45.1 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  58.14 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  45.83 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  40.38 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  45.83 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  34.67 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  42.5 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  47.92 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  45.1 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  36 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  40.54 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  35.85 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  43.75 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  43.75 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  47.92 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  45.83 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  48.84 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  47.5 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  38.89 
 
 		 112 aa  42  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  47.92 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  43.48 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  39.58 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  41.43 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  43.75 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  45.83 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  43.75 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  45.83 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  45.83 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  39.58 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  47.5 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  43.75 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  42.5 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  45.83 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  32.5 
 
 		 75 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  43.75 
 
 		 105 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>