76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1274 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 85 aa  169  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  60 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  55 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  48.68 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  60 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  58 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  47.27 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  60.98 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  37.33 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  52.94 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  52.94 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  53.49 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  51.16 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  44.44 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  42.03 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  45.1 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  38.75 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  44.74 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  43.14 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  38.57 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  47.06 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  47.5 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  48.98 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  48 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  52 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  38.96 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  47.06 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  49.02 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  52.17 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  41.98 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  38.03 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  47.06 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  46 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  46 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  40.91 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  50.94 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  46.51 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  42 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  44 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  44 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  45 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  45 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  42 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  41.03 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  35.14 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  41.03 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  40.24 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0594  FmdB family regulatory protein  47.62 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  47.73 
 
 		 65 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  38.75 
 
 		 83 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  32 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  31.48 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  39.22 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  39.73 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  34.67 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  35.71 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  38.1 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  35.53 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  38.78 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  39.39 
 
 		 66 aa  40  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0322  regulatory protein, FmdB family  32.89 
 
 		 78 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.71311  normal  0.241427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>