55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1775 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 69 aa  142  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  37.88 
 
 		 71 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  51.11 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  39.13 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  36.07 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  33.93 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  46.51 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  46.67 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  40.32 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  45.24 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  42.22 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  37.29 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  37.29 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  42.22 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  42.22 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  40.91 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  42.22 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  40.91 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  40.91 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  38.33 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  38.71 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  46.51 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  36.23 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  38.3 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  47.62 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  46.51 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  37.78 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2923  regulatory protein, FmdB family  38.3 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  38.81 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  39.58 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  39.58 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  37.78 
 
 		 94 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 110 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  44 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 65 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  44 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  43.75 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2262  hypothetical protein  35.59 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.545917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  37.78 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  42.22 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  42.22 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  39.58 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  36.36 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  32.65 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  42.55 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>