44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4083 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 75 aa  150  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  73.58 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  39.74 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  36.23 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  47.83 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  40.98 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  35 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  37.33 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  39.62 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  52.27 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  52.27 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  36.67 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  28.17 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  43.48 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  32.65 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  39.58 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  36.73 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  32.39 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  39.29 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1941  FmdB family regulatory protein  32.39 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0534197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  36.51 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  36.73 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  32.69 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  32.69 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  28.57 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  40.82 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  36.73 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  34.69 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  34.62 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  36.59 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  34.62 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  38.64 
 
 		 94 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  34.69 
 
 		 121 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  34.69 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  31.43 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  39.58 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  28 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  28.57 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  31.82 
 
 		 125 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  37.21 
 
 		 80 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>