42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1009 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  148  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  43.55 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  41.79 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  41.94 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  40.58 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  46.3 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  52.27 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  52.27 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  42.5 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  42.55 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  39.58 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  40.85 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  38.33 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  42.55 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  39.58 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  47.5 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  40.43 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  35.85 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  35.85 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  38.18 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  43.24 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  29.09 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  36.59 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  38.33 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  43.14 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  36.07 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  43.14 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0721  FmdB family regulatory protein  38.18 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.538439  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  47.5 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  36.17 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  34.04 
 
 		 125 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  41.46 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  33.8 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  44 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  34.85 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  36.11 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  39.53 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 141 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>