48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2275 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 66 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  49.02 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  38.03 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  42.42 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  42.42 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  42.59 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  39.58 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  46.51 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  46.55 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  34 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  40.35 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  39.53 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  36.67 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  40.48 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  43.18 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  39.53 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  39.53 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  38.6 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  37.78 
 
 		 80 aa  42  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  40.91 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  41.07 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  38.1 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  38.64 
 
 		 61 aa  42  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  40.91 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2262  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.545917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  39.53 
 
 		 83 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0594  FmdB family regulatory protein  38.98 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  48.57 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  35.19 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  33.85 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  36.54 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  34.09 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  38.64 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  35.29 
 
 		 80 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  38.64 
 
 		 142 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  34.09 
 
 		 85 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>