37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1995 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 83 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  53.33 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  49.02 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  53.19 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  47.83 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  41.54 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  41.54 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  47.62 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  39.74 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  45.65 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  46.67 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  36.36 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  35.29 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3030  regulatory protein, FmdB family  48.08 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  36.36 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  33.82 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  40.91 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  42.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  42.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  32.91 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  37.25 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  34.18 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  41.86 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  43.59 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  34.69 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  31.82 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  35.29 
 
 		 81 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>