23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0644 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  87.14 
 
 		 70 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  77.78 
 
 		 71 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  41.94 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  55.81 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  47.62 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  40.74 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  43.75 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  44.68 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  40.3 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  39.53 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  42.37 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  38.71 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  47.5 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  33.78 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 78 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  42.55 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  38.89 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  38.89 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  41.3 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>