38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2310 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 78 aa  160  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  55.84 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  45.95 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  48.68 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  48.68 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  51.39 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  45.83 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  45.83 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  45.83 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  41.77 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  47.22 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  48.61 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  40.28 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4252  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79426  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  42.55 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  39.53 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  41.46 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  42.5 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  42.5 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  39.53 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  39.13 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  34.85 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  40.48 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  40.48 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  39.02 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  34.88 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  37.7 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 142 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  34.92 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  36.96 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  38.1 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  38.16 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>