26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0778 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 71 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  76.06 
 
 		 70 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  74.65 
 
 		 70 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  51.16 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  46.81 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  41.94 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  40.3 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  45.24 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  37.84 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  47.5 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  34.12 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  45.65 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  41.86 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  45.24 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  34.88 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  42.22 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  45.24 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  38.1 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  42.5 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  36.73 
 
 		 75 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>