66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3203 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  153  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  42.11 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  41.57 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  41.25 
 
 		 80 aa  57  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  46 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  52.17 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  45 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  38.67 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  51.11 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  38.96 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  46.67 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  46.67 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  46 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  46 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  41.77 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  39.58 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  47.83 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  46 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  36.84 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  44.23 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  40.85 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  47.62 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  44 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  36.99 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  42.31 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  35.62 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  41.43 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  35.62 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  35.62 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  38 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  45.59 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  39.58 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  46.34 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  39.34 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  46 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  35 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  35.44 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  33.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  32.47 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  46.34 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  46.34 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  44 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  44 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  53.49 
 
 		 65 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  43.04 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  34 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  37.88 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  31.65 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  38 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  38.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  31.71 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  36.11 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  36.11 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  41.18 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  36.25 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  44.23 
 
 		 107 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>