42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1304 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 68 aa  141  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  42.11 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  42.11 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  48.84 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  48.94 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  55.81 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  40.98 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  40.98 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  41.38 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  55.81 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  58.14 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  40.74 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  38.33 
 
 		 73 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  52.17 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  39.29 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2431  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000696876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2544  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  45.59 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  47.83 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  51.16 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  45.65 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  47.92 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  35.71 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  51.16 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  41.82 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  38.81 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  32.39 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  40.91 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  32.86 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  37.18 
 
 		 87 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  33.85 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  39.53 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  46.51 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  38.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1358  hypothetical protein  37.04 
 
 		 100 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>