30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2774 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 78 aa  160  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  41.79 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  38.03 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  47.83 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  42.59 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  37.8 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  40.3 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  41.67 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  42.31 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  36.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  36.36 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  43.48 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  35.44 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  34.15 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  41.3 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  37.31 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  39.53 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  36.84 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  40.68 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  32.43 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2075  hypothetical protein  31.94 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  35.09 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1422  FmdB family regulatory protein  31.08 
 
 		 70 aa  40  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  36.84 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  37.21 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  36.73 
 
 		 61 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>