31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2441 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  100 
 
 
77 aa  152  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  40.26 
 
 
78 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  43.64 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  45.28 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2540  FmdB family regulatory protein  47.83 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3419  regulatory protein, FmdB family  45.65 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0665  FmdB family regulatory protein  44.83 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000563996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29350  putative regulatory protein, FmdB family  45.65 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0648  regulatory protein, FmdB family  45.16 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_002936  DET0734  hypothetical protein  40.91 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000750313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_640  hypothetical protein  43.1 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000170615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1245  hypothetical protein  52.17 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.265358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2210  hypothetical protein  44.44 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  43.18 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  34.15 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0322  regulatory protein, FmdB family  44.68 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.71311  normal  0.241427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  34.15 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1323  FmdB family regulatory protein  30 
 
 
80 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.334472  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1269  FmdB family regulatory protein  50 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1468  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.337511  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0865  regulatory protein, FmdB family  36.54 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000475517  normal  0.391737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  47.46 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  40.91 
 
 
66 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0433  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186737  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 
72 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1341  regulatory protein, FmdB family  39.58 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  40.38 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6110  regulatory protein, FmdB family  38.89 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  52.27 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  48.89 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1074  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>