104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3290 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  59.09 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  48.94 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  48.08 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  46.77 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  42.31 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  52.27 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  52.27 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  56.82 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  48.94 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  45.9 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  45.9 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  45.83 
 
 		 58 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  43.1 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  45.45 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  52.27 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  52.27 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  52.27 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  47.73 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  38.16 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  50 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  36.36 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  38.64 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  48.89 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  46.51 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  46.51 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  44.68 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  45.45 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  51.16 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  45.45 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  46.51 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0648  regulatory protein, FmdB family  46.77 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  42.42 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  42.55 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  36.73 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  40.91 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0829  hypothetical protein  38.64 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000274329  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  40.43 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  42.86 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  40.91 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2540  FmdB family regulatory protein  44.68 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  43.18 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  38.78 
 
 		 61 aa  42  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1341  regulatory protein, FmdB family  37.04 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  45.45 
 
 		 92 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  37.25 
 
 		 83 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  42.22 
 
 		 73 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  42.22 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  47.73 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  40.91 
 
 		 81 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  47.73 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  51.16 
 
 		 82 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  45.45 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  46.15 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  42.22 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  49.06 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  46.81 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  31.03 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  47.73 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  42.55 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  39.53 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  38.64 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  46.81 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  46.51 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2431  FmdB family regulatory protein  37.25 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000696876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  47.17 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  45.45 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  45.45 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4072  regulatory protein, putative  38.46 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  38.89 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  37.04 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  40.74 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  51.16 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  38.89 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0433  FmdB family regulatory protein  41.51 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186737  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  38.89 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  40.91 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  35.29 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  45.45 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>