48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1776 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  52.42 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  34.11 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  34.11 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  34.11 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3593  regulatory protein, putative  39.23 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  36.8 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  40.48 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4072  regulatory protein, putative  38.35 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0226  FmdB family regulatory protein  36.43 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  35.61 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0982  FmdB family regulatory protein  35.11 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  35.94 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0660  putative formamidase regulatory protein FmdB  36 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5535  normal  0.31375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1449  regulatory protein, FmdB family  36.64 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3859  putative formamidase regulatory protein FmdB  33.33 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  33.6 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  33.6 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1258  putative formamidase regulatory protein FmdB  35.04 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.973903  normal  0.160938 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2969  putative formamidase regulatory protein FmdB  33.08 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.294396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3858  putative formamidase regulatory protein FmdB  33.58 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0570  regulatory protein, putative  33.33 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  44.12 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  39.39 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 72 aa  48.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3571  hypothetical protein  32.91 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19690  putative regulatory protein, FmdB family  39.39 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850408 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6619  FmdB family regulatory protein  39.39 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6217  FmdB family regulatory protein  39.39 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6386  FmdB transcriptional regulator  39.39 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2659  FmdB transcriptional regulator  29.03 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5200  regulatory protein, FmdB family  34.33 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  44.68 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  44 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0685  putative formamidase regulatory protein FmdB  41.86 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000276666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2156  regulatory protein, FmdB family  32.31 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22410  putative regulatory protein, FmdB family  34.85 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  48.78 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2300  hypothetical protein  31.34 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641747  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  42.31 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  38.78 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  42 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  27.54 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 84 aa  40  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1722  regulatory protein, FmdB family  36.49 
 
 		 91 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>