34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0180 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 117 aa  238  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  80.67 
 
 		 115 aa  182  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0570  regulatory protein, putative  67.52 
 
 		 113 aa  160  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0226  FmdB family regulatory protein  64.71 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3593  regulatory protein, putative  65 
 
 		 116 aa  153  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4072  regulatory protein, putative  44.92 
 
 		 115 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0982  FmdB family regulatory protein  43.8 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1258  putative formamidase regulatory protein FmdB  42.86 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.973903  normal  0.160938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  47.86 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  47.86 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  44.44 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3858  putative formamidase regulatory protein FmdB  41.18 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0660  putative formamidase regulatory protein FmdB  42.37 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5535  normal  0.31375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1449  regulatory protein, FmdB family  41.18 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  45.3 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  45.3 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  45.3 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2969  putative formamidase regulatory protein FmdB  38.84 
 
 		 116 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.294396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  48.72 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  41.03 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  35.94 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3859  putative formamidase regulatory protein FmdB  39.83 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  36.97 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  41.03 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  34.62 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0685  putative formamidase regulatory protein FmdB  41.57 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000276666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  60.87 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19690  putative regulatory protein, FmdB family  38.81 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  35.29 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6217  FmdB family regulatory protein  45.65 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6619  FmdB family regulatory protein  45.65 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6386  FmdB transcriptional regulator  45.65 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  28.79 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  43.4 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>