52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5674 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 111 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 111 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3593  regulatory protein, putative  50.86 
 
 		 116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  49.11 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0570  regulatory protein, putative  53.1 
 
 		 113 aa  105  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  50.43 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  49.11 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0982  FmdB family regulatory protein  46.15 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  49.56 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  47.32 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  47.32 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0226  FmdB family regulatory protein  47.06 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1258  putative formamidase regulatory protein FmdB  43.48 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.973903  normal  0.160938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1449  regulatory protein, FmdB family  42.61 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0660  putative formamidase regulatory protein FmdB  42.98 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5535  normal  0.31375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  45.3 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3858  putative formamidase regulatory protein FmdB  41.74 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4072  regulatory protein, putative  45.69 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  34.11 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  41.96 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2969  putative formamidase regulatory protein FmdB  36.21 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.294396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  37.61 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3859  putative formamidase regulatory protein FmdB  40.17 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  37.39 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0685  putative formamidase regulatory protein FmdB  40.48 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000276666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6619  FmdB family regulatory protein  34.12 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6217  FmdB family regulatory protein  34.12 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6386  FmdB transcriptional regulator  34.12 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2615  hypothetical protein  31.25 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0153607  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  32.94 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  28.99 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  43.14 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  30.12 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  36 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  32.67 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2659  FmdB transcriptional regulator  28.83 
 
 		 95 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  28.79 
 
 		 82 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  44.23 
 
 		 109 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  44.23 
 
 		 109 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  33.8 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  35.29 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3030  regulatory protein, FmdB family  34.07 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  40.38 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2156  regulatory protein, FmdB family  34.85 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  45.1 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2300  hypothetical protein  38.24 
 
 		 96 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641747  normal  0.805269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>