30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2659 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2659  FmdB transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  189  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  30.77 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3593  regulatory protein, putative  32.48 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0226  FmdB family regulatory protein  42.25 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3571  hypothetical protein  34.02 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  45.24 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2156  regulatory protein, FmdB family  46.34 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  29.03 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1722  regulatory protein, FmdB family  35.29 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  31.82 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  34.58 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19690  putative regulatory protein, FmdB family  34.38 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0660  putative formamidase regulatory protein FmdB  29.2 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5535  normal  0.31375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2615  hypothetical protein  30.61 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0153607  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  51.28 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  28.83 
 
 		 111 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  28.83 
 
 		 111 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  28.83 
 
 		 111 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3858  putative formamidase regulatory protein FmdB  32.79 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  48.89 
 
 		 72 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  36.96 
 
 		 95 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6217  FmdB family regulatory protein  51.28 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  30 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0982  FmdB family regulatory protein  28.1 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0337  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  45.24 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  37.68 
 
 		 105 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>