22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12110 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 95 aa  185  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22410  putative regulatory protein, FmdB family  56.12 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2300  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641747  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1722  regulatory protein, FmdB family  42.11 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0077  regulatory protein, FmdB family  39.58 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5200  regulatory protein, FmdB family  34.74 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  39.39 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  36.14 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  46.34 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19690  putative regulatory protein, FmdB family  32.63 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  35.29 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  35.29 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2659  FmdB transcriptional regulator  36.96 
 
 		 95 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  35.29 
 
 		 110 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2615  hypothetical protein  41.18 
 
 		 91 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0153607  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  35.19 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 72 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 75 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>