43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1172 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 71 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  47.14 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  46.77 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  37.88 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  53.49 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  47.83 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  38.64 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  44.19 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  46.15 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  40.91 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  35.19 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  38.98 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  46.51 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  45.45 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  38.3 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  32.31 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  39.53 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  45.71 
 
 		 75 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  40.91 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.545917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  46.51 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  38.64 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  44.64 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  35.71 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  33.8 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  35.19 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  40.74 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  37.21 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  38.64 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  36.17 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  44.19 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  43.18 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1422  FmdB family regulatory protein  34.29 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  36.62 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  38.1 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 		 71 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>