39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1705 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  270  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  50 
 
 		 111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1258  putative formamidase regulatory protein FmdB  49.12 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.973903  normal  0.160938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3858  putative formamidase regulatory protein FmdB  48.25 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1449  regulatory protein, FmdB family  49.12 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0660  putative formamidase regulatory protein FmdB  47.79 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5535  normal  0.31375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  48.7 
 
 		 115 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0982  FmdB family regulatory protein  44.83 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3593  regulatory protein, putative  45.69 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0570  regulatory protein, putative  48.67 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4072  regulatory protein, putative  47.83 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  47.86 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0226  FmdB family regulatory protein  45.38 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  48.21 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  48.18 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  50.91 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  48.18 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2969  putative formamidase regulatory protein FmdB  39.66 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.294396 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  41.96 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  41.82 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  33.59 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3859  putative formamidase regulatory protein FmdB  38.46 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  33.06 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  56.52 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0685  putative formamidase regulatory protein FmdB  44.58 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000276666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  40.38 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2659  FmdB transcriptional regulator  33.04 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6217  FmdB family regulatory protein  52.17 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6619  FmdB family regulatory protein  52.17 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6386  FmdB transcriptional regulator  52.17 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  30.99 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19690  putative regulatory protein, FmdB family  34.33 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850408 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 71 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5200  regulatory protein, FmdB family  32.84 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1722  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>