32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2969 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2969  putative formamidase regulatory protein FmdB  100 
 
 		 116 aa  247  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.294396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3859  putative formamidase regulatory protein FmdB  54.24 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0570  regulatory protein, putative  38.79 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0660  putative formamidase regulatory protein FmdB  39.32 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5535  normal  0.31375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  38.84 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  39.83 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3593  regulatory protein, putative  38.66 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3858  putative formamidase regulatory protein FmdB  38.14 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1258  putative formamidase regulatory protein FmdB  36.44 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.973903  normal  0.160938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1449  regulatory protein, FmdB family  36.44 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0982  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  38.79 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4072  regulatory protein, putative  40.34 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0226  FmdB family regulatory protein  36.13 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  40.52 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  40.52 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  36.21 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  36.21 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  35.34 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  36.21 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  37.93 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  33.08 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  35.34 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  32.2 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  32.5 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  53.85 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3571  hypothetical protein  31.82 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6217  FmdB family regulatory protein  39.58 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0685  putative formamidase regulatory protein FmdB  41.3 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000276666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6619  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 74 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6386  FmdB transcriptional regulator  37.5 
 
 		 74 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19690  putative regulatory protein, FmdB family  32.84 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>