28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3859 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3859  putative formamidase regulatory protein FmdB  100 
 
 		 117 aa  245  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2969  putative formamidase regulatory protein FmdB  54.24 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.294396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0226  FmdB family regulatory protein  39.2 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0982  FmdB family regulatory protein  42.5 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1449  regulatory protein, FmdB family  41.03 
 
 		 114 aa  85.9  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3593  regulatory protein, putative  42.86 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1258  putative formamidase regulatory protein FmdB  40.68 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.973903  normal  0.160938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0660  putative formamidase regulatory protein FmdB  37.61 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5535  normal  0.31375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0570  regulatory protein, putative  44.92 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  41.53 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3858  putative formamidase regulatory protein FmdB  38.14 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  39.83 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  33.33 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4072  regulatory protein, putative  36.75 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  40.17 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  40.17 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  40.17 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  36.67 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  36.67 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  35.04 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  36.89 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  32.58 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  31.62 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  30.51 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3571  hypothetical protein  33.61 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  44.68 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  37.04 
 
 		 65 aa  40.8  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>