31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3593 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3593  regulatory protein, putative  100 
 
 		 116 aa  238  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0570  regulatory protein, putative  74.14 
 
 		 113 aa  175  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  69.83 
 
 		 115 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0226  FmdB family regulatory protein  70.25 
 
 		 119 aa  164  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  65 
 
 		 117 aa  153  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  50.86 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  50.86 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  50.86 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0982  FmdB family regulatory protein  45.3 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4072  regulatory protein, putative  47.86 
 
 		 115 aa  105  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0660  putative formamidase regulatory protein FmdB  44.83 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5535  normal  0.31375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3858  putative formamidase regulatory protein FmdB  46.55 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1258  putative formamidase regulatory protein FmdB  44.83 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.973903  normal  0.160938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1449  regulatory protein, FmdB family  43.1 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  44.83 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  44.92 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  48.28 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2969  putative formamidase regulatory protein FmdB  38.66 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.294396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3859  putative formamidase regulatory protein FmdB  42.86 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  39.23 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  43.97 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  38.79 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  41.03 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  36 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6217  FmdB family regulatory protein  41.38 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0685  putative formamidase regulatory protein FmdB  38.82 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000276666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6386  FmdB transcriptional regulator  40.23 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6619  FmdB family regulatory protein  40.23 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  43.08 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2659  FmdB transcriptional regulator  32.48 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>