45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1599 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 110 aa  233  8e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  43.64 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  42.73 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  42.73 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  40.52 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  42.86 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4072  regulatory protein, putative  42.74 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3593  regulatory protein, putative  41.03 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  40.91 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0226  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0982  FmdB family regulatory protein  39.17 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0660  putative formamidase regulatory protein FmdB  41.23 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5535  normal  0.31375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3858  putative formamidase regulatory protein FmdB  41.03 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  46.49 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1258  putative formamidase regulatory protein FmdB  41.03 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.973903  normal  0.160938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  38.33 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  46.48 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  39.5 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1449  regulatory protein, FmdB family  39.32 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0570  regulatory protein, putative  39.66 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  39.13 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2969  putative formamidase regulatory protein FmdB  35.29 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.294396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3859  putative formamidase regulatory protein FmdB  29.66 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2659  FmdB transcriptional regulator  31.82 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0734  hypothetical protein  51.22 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000750313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_640  hypothetical protein  48.78 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000170615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  43.18 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0665  FmdB family regulatory protein  43.9 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000563996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19690  putative regulatory protein, FmdB family  36.76 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850408 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  37.14 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  32.22 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2540  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  36.73 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3030  regulatory protein, FmdB family  43.75 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868912 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0865  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000475517  normal  0.391737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  45.24 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  43.18 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1341  regulatory protein, FmdB family  31.58 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141907  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  42.55 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29350  putative regulatory protein, FmdB family  39.58 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0433  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 70 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186737  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>