38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0570 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0570  regulatory protein, putative  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3593  regulatory protein, putative  74.14 
 
 		 116 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  70.43 
 
 		 115 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  67.52 
 
 		 117 aa  160  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0226  FmdB family regulatory protein  64.71 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5674  FmdB family regulatory protein  53.1 
 
 		 111 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4630  FmdB family regulatory protein  53.1 
 
 		 111 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3738  FmdB transcriptional regulator  53.1 
 
 		 111 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4072  regulatory protein, putative  50.43 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1258  putative formamidase regulatory protein FmdB  46.96 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.973903  normal  0.160938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  49.56 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  49.56 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0982  FmdB family regulatory protein  44.44 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0660  putative formamidase regulatory protein FmdB  43.86 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5535  normal  0.31375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3858  putative formamidase regulatory protein FmdB  43.48 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1449  regulatory protein, FmdB family  44.35 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  51.33 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  45.13 
 
 		 106 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2969  putative formamidase regulatory protein FmdB  38.79 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.294396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  48.67 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3859  putative formamidase regulatory protein FmdB  44.92 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  41.59 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  35.2 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  37.39 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  33.33 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0685  putative formamidase regulatory protein FmdB  42.35 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000276666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6386  FmdB transcriptional regulator  39.08 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6619  FmdB family regulatory protein  39.08 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6217  FmdB family regulatory protein  39.08 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3107  FmdB family regulatory protein  41.54 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.04976  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19690  putative regulatory protein, FmdB family  39.71 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850408 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_640  hypothetical protein  39.53 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000170615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0734  hypothetical protein  33.85 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000750313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0665  FmdB family regulatory protein  37.21 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000563996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5200  regulatory protein, FmdB family  38.24 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  26.47 
 
 		 101 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  40.74 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  31.08 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>