23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19690 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19690  putative regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 92 aa  183  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5200  regulatory protein, FmdB family  47.87 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22410  putative regulatory protein, FmdB family  41.84 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1722  regulatory protein, FmdB family  42.39 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0077  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2300  hypothetical protein  36.46 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641747  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  39.13 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  33.68 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3565  regulatory protein, FmdB family  38.81 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5505  FmdB family regulatory protein  41.18 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3683  regulatory protein, FmdB family  38.81 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  40.3 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3374  FmdB family regulatory protein  38.81 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  39.39 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0570  regulatory protein, putative  39.71 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2659  FmdB transcriptional regulator  36.99 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0599  FmdB family regulatory protein  40.3 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425603  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  36.76 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2160  hypothetical protein  44.29 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0180  FmdB family regulatory protein  38.81 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1705  hypothetical protein  34.33 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00591472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2969  putative formamidase regulatory protein FmdB  30.34 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.294396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2156  regulatory protein, FmdB family  36.25 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>